兩晉指西晉(公元265-316年)和東晉(公元317—420年)。官制大多遵循曹魏制度。重要官員多來源司馬氏宗室和士族階層。

西晉初年不設(shè)丞相，八王之亂后才又置丞相，一般由諸王或權(quán)力很大的士族擔任。丞相位高權(quán)重，《宋書·百官志》說：“自魏晉以來，非復人臣之位矣。”丞相之下，有所謂的“八公”，即太宰、太傅、太保、太尉、司徒、司空、大司馬、大將軍，由諸王或世家大族充任。八公之下，又有“位從公”之名，始于曹魏。凡開府儀同三司者都是位從公。開府指開設(shè)府第，設(shè)官建署。儀同三司，指儀仗同于太尉、司徒、司空。多加給各種名號的將軍和光祿大夫，前者是武官位從公，后者是文官位從公。

晉朝最重要的機構(gòu)是尚書臺、中書省、門下省。尚書臺，也叫尚書省，魏晉以來并用，直到南朝后期才固定稱省。晉朝尚書臺組織比東漢、曹魏時候更加嚴密。公卿權(quán)重者錄尚書事。尚書令為首，尚書仆射為副。尚書令、仆射辦公處稱都座，有左、右丞。左丞負責尚書臺內(nèi)部禁令及庶務(wù)。右丞負責庫藏廬舍及遠道文書奏章。都座以下有列曹尚書，初設(shè)有吏部、三公、客曹、駕部、屯田、度支六曹，后改吏部、殿中、五兵、田曹、度支、左民六曹。東晉則設(shè)吏部、五兵、左民、度支、祠部五曹。尚書下有三十五曹郎(尚書郎)。東晉時只設(shè)十五曹郎。從組織構(gòu)成上可以看出，尚書省是朝廷內(nèi)外、中央地方各項政務(wù)的集匯處。尚書臺轉(zhuǎn)為處理行政事務(wù)的機構(gòu)，中書省就成為機要之司，地位日漸重要。中書省設(shè)中書監(jiān)、令。其下有中書侍郎、中書通事舍人?！锻ǖ洹ぶ袝睢氛f：“魏晉以下，中書監(jiān)、令掌贊詔命，記會時事，典作文書，以其地在樞近，多承寵 任，是以人因其位，謂之鳳凰池焉?！闭f明遵照皇帝的旨意制作詔令是中書省的主要職責?！稌x書·荀勖〔xu序〕傳》記，西晉時荀勖任中書監(jiān)24年，專管機密，后改任尚書令。有人向他祝賀，他生氣地回答：“奪我鳳凰池，有什么值得慶賀的！”可見中書省所受皇帝寵 任和實際上的權(quán)力已經(jīng)超過了尚書臺。晉朝中書監(jiān)、令大多出自高門華閥，常由三公兼任。如東晉時候領(lǐng)中書監(jiān)的三公有王導、庾亮、謝安、劉裕等人，都是當時朝中握有實權(quán)的尊官。門下省由東漢的侍中寺演化而來。前文已述，曹魏的時候已有“門下”之名，西晉正式稱門下省。門下省是皇帝的近侍顧問機構(gòu)，凡涉及到重要的政令和軍國大事，皇帝一般都要向門下省咨詢。此外，門下省有“駁奏”之權(quán)，即尚書臺奏事在呈報皇帝前，須先經(jīng)門下省審閱，門下省如有不同意見，可以進行論駁，或另擬方案，與尚書臺奏事同呈皇帝定奪。東晉時門下省又有“駁詔”之權(quán)，即詔書在下受詔者之前，先下門下省審核，如有不妥，門下省可提出建議，或不下發(fā)，或改詔再發(fā)。門下省長官為侍中，下有給事黃門侍郎、散騎常侍、給事中、散騎侍郎等官。三省各有分工，彼此制衡，是繼宰相制度之后，輔政形式的一個重大變化。

兩晉仍設(shè)有列卿，但朝中庶政總領(lǐng)于尚書臺，地位明顯下降，職務(wù)也有所并省。西晉時候無中尉。東晉時候不設(shè)衛(wèi)尉、光祿勛，大鴻臚、太仆、將作大匠也不常設(shè)置。御史臺仍以中丞為主官，“督司百僚”(《晉書·傅玄傳于咸附傳》)。晉武帝時，又把謁者臺并入御史臺。西晉仍以宗室、外戚為奉車都尉、駙馬都尉、騎都尉。東晉僅存尚公主者為駙馬都尉。

宮職中，太后三卿、皇后卿的設(shè)置與曹魏時相同。惟太后三卿的地位不同于曹魏，而與東漢相同。晉武帝時候設(shè)太子官，以太子太傅、少傅領(lǐng)之。以后又有師保、詹事等官的設(shè)置，但省置不常。屬官有中庶子、中舍人、食官令、庶子、舍人、洗馬、秘書、左右衛(wèi)率、家令、仆等。

地方上實行分封制和州郡縣制0晉初，分封皇族27人為諸侯王。王國有大、中、小三等。大國有民20000戶，軍隊5000人；中國有民10000戶，軍隊3000人；小國有民5000戶，軍隊1500人。各王國可以自辟文武官屬，長官稱內(nèi)史，職如太守。西晉沿用漢魏舊制，置司隸校尉統(tǒng)司州，監(jiān)察京師和所轄各郡。東晉建都于建康(今南京市)，以揚州刺史代司隸校尉。司州之外各州設(shè)刺史，郡設(shè)太守(京師所在郡稱尹)，縣設(shè)令、長。州郡長官通常是一身二任，軍民兩政，渾然不分。絕大多數(shù)州的刺史，乃至郡守，往往帶有都督、將軍的稱號。他們既握兵符，又管民政；既有州郡佐官，又設(shè)將軍幕府，文武僚佐，縱橫捭闔〔baihe擺盒〕。東晉時候，中原士族及其部曲南遷，在江 南重置州郡縣，即稱僑州、僑郡、僑縣。

西晉封爵除王外，有公、侯、伯、子、男、鄉(xiāng)侯、亭侯、關(guān)內(nèi)侯、關(guān)中侯、關(guān)外侯等名號。職官等級則品與石混用。俸祿以斛(谷)、匹(絹)、斤(綿)并計。